1990 war Hoheneck nunmehr einzige Frauenhaftanstalt im Freistaat Sachsen. In der Justizvollzugsanstalt Hoheneck wurde Untersuchungs- und Abschiebehaft sowie Jugendarrest vollzogen. Die JVA verfügt über offenen Vollzug und eine Mutter-Kind-Station.
Die JVA Hoheneck ist ab 1994 von Frauen und Männern belegt.
Im April 2001 erfolgte die endgültige Schließung der JVA im Stollberger Ortsteil Hoheneck.